小屋の中で、少ししか開かないところがありましたよね？
隙間に細いアイテムを使えそうです。

ガラス張りの棚と、葉巻の関係は、記号のついた葉巻がボタンの押す場所を、本の一ページ目がボタンの押す順番を示しています。

本の破れている部分は見られていますか？
まだなら破れている部分に、お手持ちのアイテムを色々試してみてください。
もしどのアイテムも使えない場合は、記号のついた葉巻まわりを調べてみてください。

また、記号のついた葉巻は、それぞれが特定のボタンを示しています。
葉巻とボタン全体の形を良く見比べてみてください。
形の共通点が分かれば、それぞれの葉巻がどの場所を示しているか、分かると思います。

地下が暗くていけません
布を巻いた板(？)、オイル缶、マッチ、スプーン、大きな瓶を持ってます

所持アイテムで密閉できるものができたと思います。
井戸の水は何度でも入れ替えできます。

箱のあるところの上がどこかがポイントです。
箱のあるところへは入れないので
密閉できるアイテムを使って回収します。