その数字の箱は、本が開いてからチャレンジするところだったので、まだ解かなくても大丈夫でした。

このまま進み事も可能ですが、その場合は、3桁の数字の箱に関する謎がこれから出てくるので、不要な謎なのかや入手できないアイテムがあり、混乱はするかと思います。
きちんと謎を駆使して解き進めて行きたい場合はやり直しをおすすめします。
やり直しをしても、今の段階まで進むのに5分もかからないと思います。
やり直しをされる場合は、数字の箱は解かずにいてください。

このまま進めるならヒントを書きますが、どうされますか？