鍵は何処かに使えませんか？偶然、手に入れたアイテムでしょうか？
ペンチも何処か切ったりとか使えませんか？

木の箱から出てきたというのは、数字を入力して入手した鍵ですか？
ヒントを見ずに、無理矢理解いたという事でしょうか？
それでしたら、謎解きが前後してます。
入手出来るアイテムが入手出来なくなったり、関連するヒントが出てきた時に、混乱しそうです。
出来れば、やり直しをおすすめします。

もし、違えばこの返信は無視してください。

鉢から推測したんですね。
それもまたすごいです・・・。
本の鍵が開いてからトライするところです。
まだ序盤ですので、やり直してもすぐに追い付くと思います。

庭の何処かに４つの数字を３桁の暗証番号にするためのヒントが書いてありますよ。

小屋は真っ暗なんですね？
小屋で何かアイテムを入手出来ましたか？
何も入手していないなら、すぐに入らずに入り口で立ち止まってみてください。

入手したアイテムは、つっかえるだけが使い途とは限りません。
テコの原理も使いますよ。
使えそうなところを、色々探してみてください。

その後どうでしょう？
ボタンは、本と葉巻が重要です。
本は破れているところも見られていますか？

葉巻がボタンの押す場所を、本が押す順番を示しています。

お手持ちのアイテムで、使うためにわざわざ繋げて使うの不便でしたよね。
外して持ち運び出来たら・・・と思いませんでしたか？
今なら使える状態で持ち運び可能ですよ。

お手持ちのアイテムの、弾丸？スプレー缶？と書いているものは、井戸のからくりを解いて入手した物ですよね？
そう思って、上のヒントを出しましたがいかがでしょう？

それなら、お手持ちのアイテムで一つ、単体ではなく何処かに繋げて使ったアイテムがありますよね。
弾丸？が、その持ち手だと思ってみたらいかがでしょう。

もし、弾丸？スプレー缶？が井戸から入手したアイテムで無ければ、再度教えてください。